En estos procesos se utilizan microorganismos modificados geneticamente para producir metabolitos de alto valor agregado (por ej. aminoácidos, vitaminas, aditivos para la industria alimenticia y cosmética, biocombustibles, biofilms, tejidos celulares). La bioingeniería es de gran importancia para el futuro de diversas industrias como también para el cuidado del medio ambiente. Todavía, el estado del arte, caracterizado por incertidumbre y falta de conocimiento en tiempo real del estado del proceso, fuerza a la industria a operar los procesos en un régimen conservativo, subóptimo y no lo suficientemente intensificado, de modo de evitar estados fisiológicos indeseados para el cultivo. Esas prácticas llevan a baja eficiencia, falta de estabilidad en la operación y a un incremento en desperdicios y en el gasto energético. Con el objetivo de superar estas dificultades, existe la necesidad de identificar el estado metabólico deseado y de desarrollar métodos de control, monitoreo y optimización del proceso de manera de llevar al sistema al estado deseado en el transcurso del cultivo. Los miembros de nuestro grupo han estado participando en diferentes proyectos, desde estimación de tasa de crecimiento hasta producción de bioplásticos, microalgas y tejidos celulares.